聖方濟大殿內的墳墓，鴉雀無聲，朝聖者安安靜靜地跪著。正前方一個高台上放著方濟的棺木，周圍很多鐵條環繞，據說，方濟的遺骸從聖喬治堂移到此地之後，沒有打開過石棺，也沒有人摸過，一直到十九世紀，比約七世教宗重新勘察石棺和遺骸，但還是原封不動地放回去。整個石棺根本沒有什麼裝飾，只有樸實的石塊和鐵條圍繞，但這卻是所有到亞西西朝聖的人必須要到的最重要的地點。